Анализ геномного разнообразия SARS-Cov-2 и эпидемиологических признаков адаптации возбудителя COVID-19 к человеческой популяции (Сообщение 1)
Affiliation:
1. ФКУЗ РосНИПЧИ "Микроб"
Abstract
Вспышка COVID-19 началась в середине декабря 2019 года в городе Ухань (Китай) и быстро переросла в пандемию, которая продолжается и в настоящее время. В этом исследовании мы проанализировали информацию о 7947 полных геномах вируса SARS-CoV-2 опубликованную в базе GISAID, для изучения эволюции генома вируса при адаптации к организму человека за последние шесть месяцев. Проведен филогенетический анализ и оценка изменений в исследуемых вирусных геномах, которые могут быть разделены на четыре основных кластера. Ключевое направление эволюции генома вируса SARS-CoV-2 сопряжено с появлением единичной мутации в гене S (D614G). Установлено, что распространение штаммов с G мутацией ассоциировано не только с ростом заболеваемости, но и со снижением летальности в мире. Наблюдаемое увеличение потенциала распространения на фоне признаков снижения вирулентности, вероятно, является основной формой адаптации нового коронавируса к человеческой популяции и, по-видимому, будет продолжаться в дальнейшем в виде интеграции SARS-CoV-2 в структуру сезонных возбудителей ОРВИ.
Publisher
Russian Research Anti-Plague Institute Microbe
Reference13 articles.
1. Cui J., Li F., Shi Z.L. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nature Reviews Microbiology. 2019; 17(3):181–192. DOI: 10.1038/s41579-018-0118-9. 2. Wu F., Zhao S., Yu B., Chen Y.M., Wang W., Song Z.G., Hu Y., Tao Z.W., Tian J.H., Pei Y.Y., Yuan M.L., Zhang Y.L., Dai F.H., Liu Y., Wang Q.M., Zheng J.J., Xu L., Holmes E.C., Zhang Y.Z. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature. 2020a; 579(7798):265–269. DOI: 10.1038/s41586-020-2008-3. 3. Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, Si HR, Zhu Y, Li B, Huang CL, Chen HD, Chen J, Luo Y, Guo H, Jiang RD, Liu MQ, Chen Y, Shen XR, Wang X, Zheng XS, Zhao K, Chen QJ, Deng F, Liu LL, Yan B, Zhan FX, Wang YY, Xiao GF, Shi ZL A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020; 579(7798):270–273. DOI: 10.1038/s41586-020-2012-7. 4. Lu R.J., Zhao X., Li J., Niu P.H., Yang B., Wu H.L., Wang W.L., Song H., Huang B.Y., Zhu N., Bi Y.H., Ma X.J., Zhan F.X., Wang L., Hu T., Zhou H., Hu Z.H., Zhou W.M., Zhao L., Chen J., Meng Y., Wang J., Lin Y., Yuan J.Y., Xie Z.H., Ma J.M., Liu W.J., Wang D.Y., Xu W.B., Holmes E.C., Gao G.F., Wu G.Z., Chen W.J., Shi W.F., Tan W.J. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet. 2020b; 395(10224):565–574. DOI: 10.1016/S0140-6736(20)30251-8. 5. Wrapp D., Wang N., Corbett K.S., Goldsmith J.A., Hsieh C.-L., Abiona O., Graham, B.S., McLellan J.S. Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation. Science. 2020; 367:1260.
Cited by
2 articles.
订阅此论文施引文献
订阅此论文施引文献，注册后可以免费订阅5篇论文的施引文献，订阅后可以查看论文全部施引文献
|
|