Пептидомика: методология оценки функциональной направленности биомолекул на примере пептидов

Abstract

В статье рассмотрено использование пептидомики для прогнозирования биологической активности и функциональной направленности биопептидов путем использования предложенной методологии оценки функциональной активности биомолекул. Разработана методология оценки функциональной активности биомолекул, включающая определение природного источника белка для выделения биопептидов с учетом влияния на определенный орган и его функцию, используя эффект тропности. Следующим этапом реализации методологии является проведение биоинформационного анализа баз данных пептидов на направленного протеолиза белка с использованием необходимых ферментов и оптимизированной технологии гидролиза, что позволит получить нужную комбинацию и концентрацию целевых биомолекул. Затем полученные биокомплексы пептидов необходимо оценить на токсичность. Следующим наиболее важным этапом предложенной методологии является анализ биомолекул пептидов методом масс-спектрометрии, что позволяет провести всесторонний анализ на уровнях идентификации, количественной оценки и структурной характеристики пептидов. Затем все секвенированные и идентифицированные пептиды сопоставляются с их родительскими белками, что приводит к анализу протеома всего образца. Результат МС позволяет перейти к следующему этапу ‒ моделированию двухмерной и трехмерной структуры, что позволяет спрогнозировать различные функциональные свойства пептида. Заключительным этапом методологии функциональной оценки биопептидов является проведение исследований in vivo и in vitro с учетом предполагаемой направленности и подтверждения гипотезы.