Взаємодія пропоксазепаму з ізоформами цитохрому P450 за результатами молекулярного докінг-аналізу
-
Published:2023-07-11
Issue:3
Volume:
Page:96-104
-
ISSN:2518-153X
-
Container-title:Reports of the National Academy of Sciences of Ukraine
-
language:
-
Short-container-title:Dopov. Nac. akad. nauk Ukr.
Author:
Ларіонов В.Б.ORCID, Головенко М.Я.ORCID, Кузьмін В.Є.ORCID, Валіводзь І.П.ORCID, Нефьодов О.О.ORCID
Abstract
Методи комп’ютерного моделювання дають можливість оптимізувати процес попередньої оцінки потенціалу взаємодії майбутніх лікарських засобів. Авторами використано моделювання in silico для прогнозування та пояснення можливої взаємодії пропоксазепаму з ізоферментами CYP на молекулярному рівні. Для розрахунку вільної енергії взаємодії та визначення амінокислотних залишків процедурою молекулярного докінгу було застосовано програму iGEMDOCK v2.1, досліджувані ензими — комплекси ізоформ CYP із референтними лігандами (1A2 (2hi4), 2B6 (5uda), 2C8 (2nnj), 2C9 (1og5), 2C19 (4gqs), 2D6 (4wnu) та 3A4 (5te8), молекулами-субстратами для кожного ізоензиму вибрано відповідно фенацетин, бупропіон, амодіахін, диклофенак, S-мефенітоїн, буфуралол та мідазолам з тестостероном відповідно.
Пропоксазепам має досить високі показники вільної енергії взаємодії з усіма ізоформами CYP (8,15—9,8 ккал/моль), однак є різниця в кількості спільних амінокислотних залишків, що беруть участь у взаємодії зі специфічними субстратами. За різницею енергії зв’язків можна припустити, що найменший конкурентний (інгібувальний) ефект пропоксазепам може мати відповідно на ізоформи 3A4 (із субстратом тестостероном) та 2D6. Аналіз взаємодій пропоксазепаму з різними ізоформами CYP з урахуванням їх індивідуальних субстратів дає підставу припустити можливість конкурентної взаємодії для 1А2, 2С19 та 2С8 і, меншою мірою, для 2С9, 3А4 та 2B6. Також можна очікувати, що пропоксазепам може бути субстратом для досліджуваних ізоформ цитохрому.
Publisher
National Academy of Sciences of Ukraine (Co. LTD Ukrinformnauka) (Publications)
Reference14 articles.
1. Reder, A., Larionov, V. & Golovenko, M. (2022). Subunit-dependent interaction of propoxazepam and its metabolite with the γ-aminobuturic acid type A receptor. EUREKA: Health Sci., 5, pp. 10-18. https://doi.org/10.21303/2504-5679.2022.002649 2. Golovenko, N. Ya., Larionov, V. B., Reder, A. S. & Valivodz, I. P. (2017). An еffector analysis of the interaction of propoxazepam with antagonists of GABA and glycine receptors. Neurochem. J., 11, No. 4, pp. 302-308. https://doi.org/10.1134/S1819712417040043 3. Voloshchuk, N. I., Reder, А. S., Golovenko, M. Y., Taran, I. V. & Pashinska, О. S. (2017). Pharmacological analysis of neurochemical antinociceptive mechanisms of propoxazepam action. Pharmacology and Drug Toxicology, No. 1, pp. 3-11 (in Ukrainian). 4. Pat. 119018 UA, IPC C07D 243/24, A61K 31/5513, A61P 25/04, The use of 7-brom-5-(о-chlorophenyl)-3-propoxy-1,2-dihydro-3Н-1,4-benzdiazepine-2-one for inhibition of pain syndrome on diabethicpolyneyropathy without neurotoxic action, Reder, A. S., Andronati, S. А., Golovenko, M. Ya., Larionov, V. B. & Voloshyuk, N. I., Publ. 10.04.2019 (in Ukrainian). 5. Pat. 11,304,956 B2 US, IPC A61K 31/5513, A61P 23/00, A61P 25/08, A61P 29/00, A61K 9/00, Use of 7-bromo-5-(o-chlorophenyl)-3-propoxy-1,2-dihydro-3H-1,4-benzodiazepin-2-one for inhibition of neuropathic pain and seizures of different etiology, Reder, A. S., Adronati, S. A., Golovenko, M. Ya., Pavlovski, V. I., Kabanova, T. A., Khalimova, O. I., Larionov, V. B. & Voloshchuk, N. I., Publ. 19.04.2022.
|
|