Determination of DNA Interaction of Tetrazolato Ligand and Pt(II) Complex By Molecular Doking

Abstract

Dünyada en çok ölüme neden olan hastalıklar arasında ikinci sırada yer alan kanserin tedavisinde platin(II) temelli ilaçlar önemli yer tutmaktadır. Yüksek etkinlik nedeniyle sıklıkla tercih edilen bu ilaçların kullanımını, yan etkileri ve direnç gelişimi gibi olumsuzluklar kısıtlamaktadır. Pt(II) iyonunu içeren moleküllerin DNA ile etkileştiği bilindiğinden onu DNA’ya taşıyacak düşük toksisiteli bir ligandın geliştirilmesi önem kazanmıştır. Düşük toksisiteli olmaları nedeniyle ilaç çalışmalarında kullanımları desteklenen tetrazol halkası ve Schiff bazı grubu içeren ligant (tetrazolato) ve onun Pt(II) kompleksi çalışmamıza konu olmuştur. Bu ligant ve onun kompleksinin farklı baz dizilimlerine sahip DNA yapıları ile etkileşimi, tek başına ligandın esnek olduğu doking ve ligant-DNA yapılarının aynı anda esnek olduğu esnek doking yöntemleri kullanılarak araştırılması amaçlanmıştır. Bulgular, hem ligandın hem de onun Pt(II) kompleksinin tüm DNA yapılarına yüksek afinitesi olduğunu göstermektedir. Doking çalışmasındaki etkileşimler, en düşük: -5.225 kcal mol-1, en yüksek: -8.186 kcal mol-1 ve esnek doking çalışması için ise en düşük: -5.941 kcal mol-1, en yüksek: -7.967 kcal mol-1 olarak belirlenmiştir.