SARS-CoV-2 Point Mutation and Deletion Spectra and Their Association with Different Disease Outcomes-Reference-Cited by-同舟云学术

SARS-CoV-2 Point Mutation and Deletion Spectra and Their Association with Different Disease Outcomes

Published:2022-04-27 Issue:2 Volume:10 Page:
ISSN:2165-0497
Container-title:Microbiology Spectrum
language:en
Short-container-title:Microbiol Spectr

Author:

Martínez-González Brenda¹,Soria María Eugenia¹²,Vázquez-Sirvent Lucía¹,Ferrer-Orta Cristina³,Lobo-Vega Rebeca¹,Mínguez Pablo⁴⁵⁶,de la Fuente Lorena⁴⁵⁶,Llorens Carlos⁷,Soriano Beatriz⁷,Ramos Ricardo⁸^ORCID,Cortón Marta⁴⁵,López-Rodríguez Rosario⁴⁵,García-Crespo Carlos²,Gallego Isabel²⁹,de Ávila Ana Isabel²,Gómez Jordi⁹¹⁰,Enjuanes Luis¹¹^ORCID,Salar-Vidal Llanos¹,Esteban Jaime¹^ORCID,Fernandez-Roblas Ricardo¹,Gadea Ignacio¹,Ayuso Carmen⁴⁵,Ruíz-Hornillos Javier¹²¹³¹⁴,Verdaguer Nuria³^ORCID,Domingo Esteban²⁹^ORCID,Perales Celia¹⁹¹¹^ORCID

Affiliation:

1. Department of Clinical Microbiology, Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital, Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain

2. Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” (CSIC-UAM), Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain

3. Structural Biology Department, Institut de Biología Molecular de Barcelona CSIC, Barcelona, Spain

4. Department of Genetics & Genomics, Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital, Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain

5. Centre for Biomedical Network Research on Rare Diseases (CIBERER), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain

6. Bioinformatics Unit, Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital, Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain

7. Biotechvana, “Scientific Park”, Universidad de Valencia, Valencia, Spain

8. Unidad de Genómica, “Scientific Park of Madrid”, Campus de Cantoblanco, Madrid, Spain

9. Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain

10. Instituto de Parasitología y Biomedicina ‘López-Neyra’ (CSIC), Parque Tecnológico Ciencias de la Salud, Granada, Spain

11. Department of Molecular and Cell Biology, Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC), Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, Spain

12. Allergy Unit, Hospital Infanta Elena, Valdemoro, Madrid, Spain

13. Instituto de Investigación Sanitaria-Fundación Jiménez Díaz University Hospital, Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain

14. Faculty of Medicine, Universidad Francisco de Vitoria, Madrid, Spain

Abstract

The study shows that mutant spectra of SARS-CoV-2 from diagnostic samples differ in point mutation abundance and complexity and that significantly larger values were observed in virus from patients who developed mild COVID-19 symptoms. Mutant spectrum complexity is not a uniform trait among isolates. The nature and location of low-frequency amino acid substitutions present in mutant spectra anticipate great potential for phenotypic diversification of SARS-CoV-2.

Funder

MEC | Instituto de Salud Carlos III

MEC | Consejo Superior de Investigaciones Científicas

Fundació la Marató de TV3

Ministerio de Ciencia e Innovación

Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades

Comunidad de Madrid

Instituto de Salud Carlos III

Ministerio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de España

Publisher

American Society for Microbiology

Subject